تأسس عام 1989، وباشر عملياته الإقراضية عام 1991 كمؤسسة حكومية ذات استقلال مالي وإداري تعني بتنمية وتمويل المشاريع الصغيرة والمتوسطة والمتناهية الصغر (الميكروية) من خلال إيراداته الذاتية، ولمواكبة التطورات الاجتماعية والاقتصادية.
وتم إصدار قانون صندوق التنمية والتشغيل رقم (33) للعام 1992 وتعديلاته.
ويتولى إدارة الصندوق مجلس إدارة برئاسة معالي وزير العمل، وعضوية كل من المدير العام للصندوق والأمناء العامون لوزارات التخطيط والتعاون الدولي والمالية والتنمية الاجتماعية، وأربعة ممثلين عن القطاعات الاقتصادية والإنتاجية والخدمية يسميهم مجلس الوزراء بناءً على تنسيب رئيس المجلس لمدة سنتين قابلة للتجديد لمدة مماثلة ولمرة واحدة.